Les peuples autochtones du Panama, qui représentent environ 200.000 personnes, (8,4 % de la population du pays), sont les Ngöbe, les Kuna, les Embera, les Bugle, les Wounaan, les Naso et les Bribri.
Leurs droits sont incorporés dans la Constitution et ils sont régis par une série de lois et de réglementations. La création des comarcas autochtones, les lois constitutionnelles gouvernant leurs territoires illustrent la reconnaissance de leurs structures administratives et politiques traditionnelles.
Les comarcas légalisées sont les trois comarcas des Kuna : des Kuna Yala, établie en 1938, des Kuna de Madungandi, des Kuna de Wargandi et les comarcas des Embera-Wounnaan et celle des Ngöbe-Bugle. La réglementation de la troisième comarca kuna n'est pas encore totalement établie.